Statistisk
Forening i Bergen
Opprettet 15/12 1983
|
Styret 2002 |
|
|
|
|
Formann |
Grethe Albrektsen |
Seksjon for medisinsk
statistikk, ISF, UiB |
Tlf. 55 97 46 02 |
|
Sekretær |
Astrid Lunde |
Matematisk institutt, UiB |
Tlf. 55 97 60 61 |
|
Kasserer |
Terje Schaathun |
Vital forsikring ASA |
Tlf. 55 17 84 10 |
|
Styremedlem |
Jan Aarseth |
MS-register, Nevrologisk
avdeling, Haukeland Sykehus |
Tlf. 55 97 60 61 |
Opp mot akkuttmottak på sørsiden av Haukeland Sykehus,
sving til høyre foran teknisk sentral og kjør helt opp på toppen av bakken - vær presis, dørene låses!
Azadeh
Badiee (NTNU-utdannet) som arbeider ved Senter for medisinsk genetikk og
molekylær medisin ved Haukeland sykehus og Trond Hellem Bø som er
doktorgradsstudent ved institutt for informatikk, UiB, vil holde foredrag med
tittel
Mikromatriser
er en relativt ny teknologi som brukes til parallelt å måle cellers relative
bruk (uttrykksnivå) av tusenvis av gener. Typiske mikromatriser gir målinger
for 10000-20000 gener, og er bl.a. blitt brukt til sykdomsstudier (som f.eks.
kreft) og også i studier av cellesykluser.
Mikromatrise målinger kan inneholde mye varians som ikke nødvendigvis har en biologisk forklaring, noe som er en utfordring når man skal analysere dataene. De mange mulige (ikke-biologiske) kildene til varians krever at man prøver å kontrollere og begrense disse i så stor grad som mulig. Fjerning av ikke-biologisk varians, såkalt normalisering, er blitt en standard prosedyre å gjøre før man starter med videre analyse. Mikromatrise-teknologien gir også en del problemstillinger innen eksperiment-design, som f.eks. hvordan få mest mulig informasjon om det man ønsker å studere uten at det blir for dyrt eller arbeidskrevende. Samtidig er det et ønske at man skal kunne skille mellom varians som har en biologisk forklaring, og varians som stammer fra andre kilder.
I sykdomsstudier er man interessert i hvilke gener som har et endret uttrykksnivå ved sammenligning av to eller flere grupper av vev. Grupper av vev kan f.eks. være syke/friske, med/uten medisinering, godartet/ondartet osv. Grunnet det store antallet med gener regner man med at f.eks. en t-test (to grupper) for hvert enkelt gen vil gi mange falske positive, mens f.eks en Bonferroni korreksjon av p-verdiene ofte viser seg å være alt for konservativ. Videre er det av interesse å studere om pålitelige diagnoser kan stilles basert på mikromatrise-målinger. Man ønsker i så tilfelle å finne en mengde gener hvor målingene av uttrykksnivåene til disse gir mest mulig informasjon om forskjellene mellom gruppene. I tillegg ønsker man estimater for hvor sikre diagnosene som stilles vil være.
Foredraget
vil gi en introduksjon til mikromatrise-teknologien, samt gi en oversikt over
en del "løste" og delvis løste problemstillinger som kan være av
interesse for statistikere.
En litteraturoversikt finner du her:
Møte
er åpent for BSF medlemmer og andre interesserte.
Møtet
avsluttes med en enkel servering.
VELKOMMEN!