Genenes pakking i kromatin bærer informasjon om hvordan de uttrykkes
Informasjonen er lagret i form av biokjemiske modifikasjoner av bestemte aminosyrer i histonene. For eksempel gir metylgrupper på den niende aminosyren på histon H3 informasjon om at genet skal være skrudd av. Dersom samme aminosyre er acetylert, er dette derimot et tegn på at genet kan være aktivt.
Histonmodifiserende enzymer
Slike proteiner spiller en avgjørende rolle for at genene skal uttrykkes i riktige celler og til rett tid.
Siden noen av histonmodifikasjonene kan kopieres og bevares på samme sted gjennom mange cellegenerasjoner, kan disse histonmodifikasjonenene tjene som medium for "cellulær hukommelse". Dette fenomenet er kjent som epigenetisk genregulering.
Illustrasjonen viser en strukturmodell av et nukleosom (pdb:1aoi) hvor de åtte histoneproteinene er farget lysegrønne mens DNA-molekylet er flerfarget. En av aminosyrene på histon H3 som kan modifiseres ved metylering er farget blå.
Kromosomenes kromatin er organisert som nukleosomer
Nukleosomet er kromosomenes strukturelle grunnenhet. Nesten all vår DNA er pakket med histoner som ca 150 basepar DNA er kveilet rundt. Den primære oppgaven til histonene er rett og slett å pakke de nesten 2 meter med DNA slik at det får plass i en 10 mikrometer stor cellekjerne uten at det blir virvar. Men, histonene merkes også biokjemisk slik at de bærer informasjon om hvilke gener som skal være av eller på.
I vår gruppe utforsker vi proteiner og proteindomener som binder til nukleosomer og "leser" og "skriver" informasjon i nukleosomenes histoner. I vår forskning benytter vi metoder og teknologi fra både molekylærbiologi, biokjemi og bioinformatikk.
-
PhD position open: Nucleosome4D project
EU FP7 Marie Curie Initial Training Network
Nucleosome4D is a Marie Curie Initial Training Network funded under the 7th Framework Programme of the European Commission. The network involves 22 research groups from different countries who will carry out multidisciplinary collaborative research projects focused on deciphering nucleosome structure and function across biological space and time (Nucleosome4D). Our network strives to provide an ideal environment for interdisciplinary learning, research and career development.