Universitetet i Bergen


NY DOKTORGRAD

Oppdaging av mønster i proteinsekvenser.

Cand. scient. Inge Jonassen (28) disputerer 26. juni 1996 for dr. scient. graden ved Universitetet i Bergen med avhandlingen:

Methods for finding motifs in sets of related biosequences

Jonassens avhandling omhandler datamaskinbaserte metoder for automatisk oppdaging av mønster i mengder med relaterte proteinsekvenser, f.eks. sekvenser til protein med samme funksjon. Slike mønster kan gi verdifull informasjon om sammenhenger mellom proteinenes sekvens, struktur og funksjon, og kan også brukes til klassifisering av nye sekvenser. Jonassen gir først en oversikt over og en systematisering av tidligere rapporterte metoder for mønsteroppdaging i biosekvenser. I flere arbeider beskriver han nye metoder som er i stand til å oppdage mønster av generell karakter. Han foreslår også nye metoder for evaluering av oppdagede mønster. Disse metodene for oppdaging og evaluering er implementert i program som har blitt gjort tilgjengelig for biologiske forskningsmiljø. Avhandlingen inneholder eksperimentelle resultat som viser at metodene kan brukes til effektivt å oppdage biologisk interessante mønster.

Personalia:
Inge Jonassen er født i Bergen. Han har studert realfag ved Universitetet i Bergen siden 1986 og avla i 1992 cand. scient. eksamen ved Institutt for Informatikk. Hovdedfagsarbeidet ble gjort med tilknytning til IBM Bergen Scientific Center. Jonassen ble i 1993 tatt opp som dr.scient. student ved matematisk-naturvitenskapelig fakultet ved Universitetet i Bergen. Jonassen er ansatt som stipendiat ved Institutt for Informatikk, og er finansiert av et personlig doktorgradsstipend fra Norges Forskningsråd. I perioden september 1994 til mars 1995 arbeidet Jonassen ved European Bioinformatics Insitute (EBI) i England.

Tidspunkt og sted for disputasen: 26. juni kl.10.15, Stort Aud.,rom 2144, Høyteknologisenteret

Kontaktpersoner
Cand.scient. Inge Jonassen, tlf. 55 58 47 13
Informasjonskonsulent Morten Steffensen, tlf. 55 58 90 35 (a)/ 55 20 02 91 (p)