| OPPGAVE 3 Diffusjonsavbildning
(innlevering pr. e-mail innen 10.11)
1. Gjør rede for prinsippene for diffusjonsavbildning
(DWI / DTI) med bruk av MRI teknikker.
Hva er det en ønsker å avbilde/måle?
2. Gi eksempler på anvendelser (kliniske og eksperimentelle)
3. Hva er ADC og AI ? (hvordan kan de estimeres fra data, i.e. DWI-opptakene)
4. Hvilke overveielser man man gjøre under tolkning av DWI-bildene
versus tolkning
av beregnede ADC-, ADC_trace- og AI parameter-bilder.
5. Kan du ved bruk av Matlab estimere gjennomsnittlig ADC_trace- og
AI- verdier i corpus
callosum, i grå substans (cortex, subcorticale
kjerner), og i CSF hos personen A.F. når
du har gitt de tre axiale DWI-snittene i fila
'DWI_afi_axi.mat' ?
Bruk Matlab-scriptene som du har fått tilgang
til under kurset (inkl. metode for å
tegne treningsmasker og evt. bruk av k-means clustering
for å segmentere regioner
med hhv. corpus callosum, grå substans og
CSF).
Hint: Ta utgangspunkt i m-funksjonen
al_dwi_3b_adc_ai_map.m
og modifiser koden
slik at du også får lest inn en
treningsmaske med de vevsspesifikke regioner.
Fargekoding og metode for å finne koordinatene
til vevsregionen du har valgt ut er gitt
gjennom å se nøye på
m-skriptet mri_netlab_knn_w_mask.m
Dvs. lag en vektor av ADC-beregninger som
bare inneholder pixler fra en gitt region,
spesifisert ved en fargkode/maskeverdi. Se
hint_oppg3.m
NB! Bruk 'hint_oppg3.m' datert
28-OCT-2000 (en feil i forrige versjon)
Beskriv i tekst din fremgangsmåte og legg frem
resultatene (gj.snitt og standard avvik)
i form av tall og treningsmasker.
Dere må gjerne utveksle treningsmasker og
Matlab-kode under arbeidet med oppgaven.
- Arvid
 Litteratur:
Le Bihan D (ed.) Diffusion and Perfusion Magnetic Resonance
Imaging: Applications
to Functional MRI. Raven Press, N.Y., 1995.
Martell AI, Allder SJ, Delay GS, Morgan PS, Moody AR.
Reproducibility of infarct volume measurements made using
adaptive segmentation
of diffusion weighted MR images. (PDF)
Lenker / Supplerende stoff:
Bildediagnostikk ved akutt hjerneslag (fra Modul 2)
http://www.uib.no/med/avd/miapr/arvid/MOD2/hjemmeeksamen2000.html
The functional MRI network
http://www.duke.edu/~richwarp/fmri.html
Diffusion-weighted MRI / Stanford Stroke Center
(M. Moseley)
http://www-radiology.stanford.edu/~mike/dwiMM.htm
Diffusion-Weighted Spin-Echo EPI Sequence in Combination
with the FLAIR-Technique: Application to Intraaxial Tumors
http://www.dkfz-heidelberg.de/mrphys/diffusion/jh_98.html
Diffusion-Weighted Single-Shot STEAM MRI (PDF)
http://www.mpibpc.gwdg.de/abteilungen/NMR/conferences/2000_un_ismrm.html
Diffusion Tensor Imaging of Newborns (PDF)
http://spl.bwh.harvard.edu:8000/pages/projects/neonatal/baby.html
Echo-planar imaging (EPI) and functional MRI by
M.S. Cohen (PDF)
http://thelonius.loni.ucla.edu/Papers/EPI-fMRI.html
Cortical spreading depression in the gyrencephalic feline
brain studied by magnetic resonance imaging (PDF)
http://www-user.uni-bremen.de/~bockhors/Literatur/J_Physiol_full_21th.html
Nye avanserte anvendelser av diffusjonsavbildning
eller avbildning av
mikroskopiske forflytninger:
Song AW,Takahash AM.
Displacement Encoded Imaging of Small Electric Current,
ISMRM 2000 (PDF) |
