Hjem
Jarl Giskes bilde

Jarl Giske

Professor, Marin dekan
  • E-postJarl.Giske@uib.no
  • Telefon+47 992 05 975
  • Besøksadresse
    Thormøhlensgt. 53 A/B
  • Postadresse
    Postboks 7803
    5020 Bergen

English:

My current research interest is how to evolve adaptations. The major tool for this is the Genetic Algorithm. Currently I use it to evolve decisions, behaviour and life histories in fish.

My interest in decisions has been a long walk starting with life-history-based optimizations. Triggered by how organisms are able to perform decisions that (seemingly) simultaneously can incorporate state-, age-, density-, and environment-dependent trade-off, I started with Geir Huse to model adaptations through Artificial Neural Networks, Genetic Algorithms, and Individual-Based Modelling. Later, I have focused (with Per Jakobsen, Marc Mangel and the TE colleagues) even more on how the decision archtecture in fish works, and how this can be utilised in modelling.

 

 

Norsk:

Jarl Giskes forskning er fokusert på forståelse av atferd, livssyklus og romlig utbredelse av dyreplankton og fisk. Dynamikken i økosystemet er summen av alle hendelser hos alle individer i alle arter. Det enkelte individs atferd er nesten alltid påvirket av mange faktorer samtidig, så som risiko for å bli spist, mulighet til å finne mat, temperatur og årstid. Matematisk modellering kan derfor være et nødvendig redskap for å forstå begivenhetene. Evolusjonen har gjennom naturlig seleksjon formet livssyklusene og atferdene til akvatiske organismer, slik at de er tilpasset både naturforholdene og andre levende organismer. Selv om det enkelte individ ikke har innsikt i sitt eget liv, så har evolusjonen formet sanseapparet og atferdsresponsene slik at organismen reagerer "fornuftig" på miljøforholdene. For å forstå dynamikken i et økosystem er det derfor nødvendig å forstå hva som motiverer organismene til å ha den atferden de har. Giskes forskning har derfor konsentrert seg om å forstå hva som motiverer individene til å handle, og dette har resultert i matematiske modeller for sild, lodde, torsk, laksesild og dyreplankton. Giske har også (sammen med Per Jakobsen) skrevet en lærebok på norsk om evolusjon og økologi.

BIO 110 Evolusjon og økologi

VIT 210 Mennesket: natur og kultur

 

Updated publication list can be found here:

http://bio.uib.no/te/jg/publications.php

 

Artikler, leserbrev og kronikker på norsk finnes her:

http://bio.uib.no/te/jg/samfunnsdebatt.php

 

 

Bøker
  • Giske, Jarl; Jakobsen, Per Johan. 2007. Evolusjon og økologi. En innføring. 2. utgave. Fagbokforlaget. 417 sider. ISBN: 978-82-450-0543-1.
  • Giske, Jarl; Jakobsen, Per Johan. 1999. Evolusjon og økologi - en innføring. Fagbokforlaget. 384 sider. ISBN: 82-7674-483-4.
Tidsskriftartikler
  • Andersen, Bjørn Snorre; Jørgensen, Christian; Eliassen, Sigrunn; Giske, Jarl. 2016. The proximate architecture for decision-making in fish. Fish and Fisheries. 17: 680-695. doi: 10.1111/faf.12139
  • Eliassen, Sigrunn; Andersen, Bjørn Snorre; Jørgensen, Christian; Giske, Jarl. 2016. From sensing to emergent adaptations: Modelling the proximate architecture for decision-making. Ecological Modelling. 326: 90-100. doi: 10.1016/j.ecolmodel.2015.09.001
  • Folkvord, Arild; Gundersen, Geir; Albretsen, Jon; Asplin, Lars; Kaartvedt, Stein; Giske, Jarl. 2016. Impact of hatch date on early life growth and survival of Mueller’s pearlside (Maurolicus muelleri) larvae and life-history consequences. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 73: 163-176. doi: 10.1139/cjfas-2015-0040
  • Folkvord, Arild; Gundersen, Geir; Albretsen, Jon; Asplin, Lars; Kaartvedt, Stein; Giske, Jarl. 2016. Impact of hatch-date on early life growth and survival of Mueller's pearlside (Maurolicus Muelleri) larvae and life-history consequences. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 73: 163-176. doi: 10.1139/cjfas-2015-0040
  • Ni, Yuanming; Eskeland, Gunnar; Giske, Jarl; Hansen, Jan Petter. 2016. The global potential for carbon capture and storage from forestry. Carbon Balance and Management. 11:3. doi: 10.1186/s13021-016-0044-y
  • Stillman, Richard A.; Railsback, Steven F.; Giske, Jarl; Berger, Uta; Grimm, Volker. 2015. Making predictions in a changing world: The benefits of individual-based ecology. BioScience. 65: 140-150. doi: 10.1093/biosci/biu192
  • Thingstad, T. Frede; Pree, Bernadette; Giske, Jarl; Våge, Selina. 2015. What difference does it make if viruses are strain-, rather than speciesspecific? Frontiers in Microbiology. 6:320. doi: 10.3389/fmicb.2015.00320
  • Giske, Jarl; Eliassen, Sigrunn; Fiksen, Øyvind; Jakobsen, Per Johan; Aksnes, Dag Lorents; Mangel, Marc; Jørgensen, Christian. 2014. The emotion system promotes diversity and evolvability. Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciences. 281. doi: 10.1098/rspb.2014.1096
  • Godø, Olav Rune; Handegard, Nils Olav; Browman, Howard; Macaulay, Gavin; Kaartvedt, Stein; Giske, Jarl; Ona, Egil; Huse, Geir; Johnsen, Espen. 2014. Marine ecosystem acoustics (MEA): Quantifying processes in the sea at the spatio-temporal scales on which they occur. ICES Journal of Marine Science. 71: 2357-2369. doi: 10.1093/icesjms/fsu116
  • Thingstad, Tron Frede; Våge, Selina; Storesund, Julia Endresen; Sandaa, Ruth-Anne; Giske, Jarl. 2014. A theoretical analysis of how strain-specific viruses can control microbial species diversity. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111: 7813-7818. doi: 10.1073/pnas.1400909111
  • Våge, Selina; Storesund, Julia Endresen; Giske, Jarl; Thingstad, T. Frede. 2014. Optimal defense strategies in an idealized microbial food web under trade-off between competition and defense. PLoS ONE. 9. doi: 10.1371/journal.pone.0101415
  • Castellani, Marco; Våge, Selina; Strand, Espen; Thingstad, Tron Frede; Giske, Jarl. 2013. The Scaled Subspaces Method: A new trait-based approach to model communities of populations with largely inhomogeneous density. Ecological Modelling. 251: 173-186. doi: 10.1016/j.ecolmodel.2012.12.006
  • Giske, Jarl; Eliassen, Sigrunn; Fiksen, Øyvind; Jakobsen, Per Johan; Aksnes, Dag Lorents; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc. 2013. Effects of the emotion system on adaptive behavior. American Naturalist. 182: 689-703. doi: 10.1086/673533
  • Våge, Selina; Castellani, Marco; Giske, Jarl; Thingstad, Tron Frede. 2013. Successful strategies in size structured mixotrophic food webs. Aquatic Ecology. 47: 329-347. doi: 10.1007/s10452-013-9447-y
  • Giske, Jarl; Jakobsen, Per Johan; Jørgensen, Christian. 2012. Hva er et menneske? Hjernen mellom natur og kultur i et langt, historisk perspektiv. Arr. Idéhistorisk tidsskrift. 24: 81-85.
  • Vincenzi, Simone; Crivelli, Alain J.; Giske, Jarl; Satterthwaite, William H.; Mangel, Marc. 2012. Selective consequences of catastrophes for growth rates in a stream-dwelling salmonid. Oecologia. 168: 393-404. doi: 10.1007/s00442-011-2096-8
  • Grimm, Volker; Berger, Uta; DeAngelis, Donald L.; Polhill, J Gary; Giske, Jarl; Railsback, Steven F. 2010. The ODD protocol A review and first update. Ecological Modelling. 221: 2760-2768. doi: 10.1016/j.ecolmodel.2010.08.019
  • Amundsen, Trond; Folstad, Ivar; Giske, Jarl; Slagsvold, Tore; Stenseth, Nils Christian. 2009. "Ida" er oversolgt. Aftenposten (morgenutg. : trykt utg.). Publisert 2009-06-03.
  • Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc; Giske, Jarl. 2009. Quantifying the adaptive value of learning in foraging behavior. American Naturalist. 174: 478-489. doi: 10.1086/605370
  • Giske, Jarl. 2009. Bli liv! Evolusjonens motor og begynnelse. Naturen. 13-25.
  • Giske, Jarl. 2009. 150 år underveis mot den store syntesen. Vantro, tvil og tro på Darwin i ny sakprosa. Prosa - tidsskrift for skribenter. 3. 20-26.
  • Giske, Jarl. 2009. Darwins farlige ide. Klassekampen. Publisert 2009-02-14.
  • Giske, Jarl. 2009. Hoffnarrens tale: et ID-blikk på Darwinjubileet og evolusjonsteorien. Naturen. 1. 63-64.
  • Giske, Jarl. 2009. Gud + evolusjonen = sant + nyttig? Naturen. 1. 61-62.
  • Giske, Jarl. 2008. Benefitting from bibliometry. Ethics in Science and Environmental Politics. 8: 79-81. doi: 10.3354/esep00075
  • Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc; Giske, Jarl. 2007. Exploration or exploitation: life expectancy changes the value of learning in foraging strategies. Oikos. 116: 513-523. doi: 10.1111/j.2006.0030-1299.15462.x
  • Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Giske, Jarl. 2006. Co-existence of learners and stayers maintains the advantage of social foraging. Evolutionary Ecology Research. 8: 1311-1324.
  • Grimm, Volker; Berger, Uta; Bastiansen, Finn; Eliassen, Sigrunn; Ginot, Vincent; Giske, Jarl; Goss-Custard, John; Grand, Tamara; Heinz, Simone K.; Huse, Geir; Huth, Andreas; Jepsen, Jane U.; Jørgensen, Christian; Mooij, Wolf M.; Müller, Birgit; Pe'er, Guy; Piou, Cyril; Railsback, Steven F.; Robbins, Andrew M.; Robbins, Martha M.; Rossmanith, Eva; Rüger, Nadja; Strand, Espen; Souissi, Sami; Stillman, Richard A.; Vabø, Rune; Visser, Ute; DeAngelis, Donald L. 2006. A standard protocol for describing individual-based and agent-based models. Ecological Modelling. 198: 115-126. doi: 10.1016/j.ecolmodel.2006.04.02
  • Giske, Jarl. 2003. Replikatologi. Naturen. 127: 151-172.
  • Giske, Jarl. 2003. Susan Blackmore: Memesket. Naturen. 127: 188-190.
  • Giske, Jarl. 2003. Lærer vi av Darwin-debatten? Vårt land. 20-21. Publisert 2003-06-04.
  • Giske, Jarl. 2003. Darwin på hjernen. Bergens Tidende. Publisert 2003-08-12.
  • Giske, Jarl; Mangel, Marc; Jakobsen, Per Johan; Huse, Geir; Wilcox, Chris; Strand, Espen. 2003. Explicit trade-off rules in proximate adaptive agents. Evolutionary Ecology Research. 5: 835-865.
  • Fiksen, Øyvind; Aksnes, Dag Lorents; Flyum, Magni H.; Giske, Jarl. 2002. The influence of turbidity on growth and survival of fish larvae: a numerical analysis. Hydrobiologia. 484: 49-59.
  • Strand, Espen; Huse, Geir; Giske, Jarl. 2002. Artificial evolution of life history and behavior. American Naturalist. 159: 624-644.
  • Giske, Jarl. 2001. Millenium Man. Naturen. 1. 30-34.
  • Giske, Jarl; Huse, Geir; Berntsen, Jarle. 2001. Spatial modelling for marine resource management, with a focus on fish. Sarsia. 86: 405-410.
  • Giske, Jarl; Jakobsen, Per. 2000. Den evolverte hjernen. Bergens Tidende. Publisert 2000-01-14.
  • Jakobsen, Per; Giske, Jarl. 2000. Av natur er du kommet, til kultur er du blitt. Bergens Tidende. Publisert 2000-02-18.
  • Huse, Geir; Strand, Espen; Giske, Jarl. 1999. Implementing behaviour in individual-based models using neural networks and genetic algorithms. Evolutionary Ecology. 13: 469-483.
  • Nøttestad, Leif; Giske, Jarl; Holst, Jens Chr.; Huse, Geir. 1999. A length-based hypothesis for feeding migrations in pelagic fish. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 56 (Suppl. 1): 26-34.
  • Giske, Jarl; Huse, Geir; Fiksen, Øyvind. 1998. Modelling spatial dynamics of fish. Reviews in Fish Biology and Fisheries. 8: 57-81.
  • Huse, Geir; Giske, Jarl. 1998. Ecology in Mare Pentium; an individual-based spatio-temporal model for fish with adapted behaviour. Fisheries Research. 37: 163-178.
  • Eiane, Ketil; Aksnes, Dag Lorents; Giske, Jarl. 1997. The significance of optical properties in competition among visual and tactile planktivores: a theoretical study. Ecological Modelling. 98: 123-136.
  • Giske, Jarl; Salvanes, Anne Gro Vea. 1995. Why Pelagic Planktivores should be Unselective Feeders. Journal of Theoretical Biology. 173: 41-50.
  • Giske, Jarl; Aksnes, Dag Lorents; Balino, B.M.; Kaartvedt, Stein; Lie, U.; Nordeide, J. T.; Salvanes, Anne Gro Vea; Wakili, S. M.; Aadnesen, Agnes. 1990. Vertical distribution and trophic interactions of zooplankton and fish in Masfjorden, Norway. Sarsia. 75: 65-81.
Rapporter/avhandlinger
  • Drange, Helge; Alendal, Guttorm; Thorkildsen, Finn; Johannessen, Ola M; Vinkler, Dick; Ulvesæter, Atle; Johansen, Torild; Giske, Jarl. 1998. Geophysical/Economical Feasibility Study of Ocean Disposal of CO2 at Haltenbanken. NERSC Technical Report. 138. The Nansen Environmental and Remote Sensing Center. 180 sider.
  • Stenevik, Erling Kåre; Giske, Jarl; Brattegard, T.; Nylund, Are. 1997. Biological impact of CO2 disposal in Norwegian waters: Preliminary review. IFM rapport. 2. Inst. for fiskeri- og marinbiologi, Univ. i Bergen. 29 sider.
  • Giske, Jarl. 1990. Habitat profitability for pelagic animals : adaptive values along continuous vertical gradients. 1 sider.
Bokkapitler
  • Bauer, Silke; Nolet, Bart A.; Giske, Jarl; Chapman, Jason W.; Åkesson, Susanne; Hedenström, Anders; Fryxell, John M. 2011. Cues and decision rules in animal migration. Chapter 6, sider 68-87. I:
    • Milner-Gulland, E.J.; Fryxell, John M; Sinclair, A. R. E. 2011. Animal migration: a synthesis. Oxford University Press. 280 sider. ISBN: 978-0-19-956899-4.
  • Huse, Geir; Giske, Jarl. 2004. 33. Utilizing different levels of adaptation in individual-based modeling. 507-521. I:
    • Seuront, Laurent; Strutton, Peter G. 2004. Handbook of scaling methods in aquatic ecology. Measurement, analysis, simulation. CRC Press. ISBN: 0-8493-1344-9.
  • Thingstad, Tron Frede; Giske, Jarl. 2003. Models and functioning of marine ecosystems. Elektronisk ressurs. I:
    • UNESCO, . 2003. Encyclopedia of Life Support Systems (EOLSS)[elektronisk ressurs].
  • Huse, Geir; Giske, Jarl; Salvanes, Anne Gro Vea. 2002. Individual based modelling. Kap. 11, sider 228-248. I:
    • Hart, Paul J. B.; Reynolds, John D. 2002. Handbook of Fish Biology and Fisheries. Vol. 2. Fisheries. ISBN: 0-632-06482-X.
  • Mangel, Marc; Fiksen, Øyvind; Giske, Jarl. 2001. Chapter 4. Theoretical and statistical models in natural resource management and research. 57-72. I:
    • [Mangler etternavn], [Mangler fornavn]. 2001. Modeling in natural resource management. Development, interpretation, and application. ISBN: 1-55963-740-4.
  • Carlotti, Francois; Giske, Jarl; Werner, Francisco. 2000. Modelling zooplankton dynamics. 571-667. I:
    • Harris, Roger; Wiebe, Peter; Lenz, Jürgen; Skjoldal, Hein Rune; Huntley, Mark. 2000. ICES Zooplankton Methodology Manual. ISBN: 0-12-327645-4.
  • Giske, Jarl; Salvanes, Anne Gro Vea. 1999. Chapter 2. A model of enhancement potentials in open ecosystems. 22-36. I:
    • Howell, Bari R.; Moksness, Erlend; Svåsand, Terje. 1999. Stock enhancement and sea ranching. ISBN: 0-85238-246-4.
  • Giske, Jarl. 1998. Evolutionary models for fisheries management. 377-386. I:
    • Pitcher, Tony J.; Hart, Paul J.B.; Pauly, Daniel. 1998. Reinventing Fisheries Management. ISBN: 0-412-83410-3.
  • Giske, Jarl; Skjoldal, Hein Rune; Slagstad, Dag. 1998. Ecological Modelling for Fisheries. 11-68. I:
    • Rødseth, Tor. 1998. Models for Multispecies Management.

Se fullstendig oversikt over publikasjoner i CRIStin.

Forskergrupper