Hjem
  • E-postJarl.Giske@uib.no
  • Telefon+47 55 58 22 10+47 992 05 975
  • Besøksadresse
    Thormøhlens gate 53 A/B
  • Postadresse
    Postboks 7803
    5020 Bergen

English:

My current research interest is how to evolve adaptations. The major tool for this is the Genetic Algorithm. Currently I use it to evolve decisions, behaviour and life histories in fish.

My interest in decisions has been a long walk starting with life-history-based optimizations. Triggered by how organisms are able to perform decisions that (seemingly) simultaneously can incorporate state-, age-, density-, and environment-dependent trade-off, I started with Geir Huse to model adaptations through Artificial Neural Networks, Genetic Algorithms, and Individual-Based Modelling. Later, I have focused (with Per Jakobsen, Marc Mangel and the TE colleagues) even more on how the decision archtecture in fish works, and how this can be utilised in modelling.

 

 

Norsk:

Jarl Giskes forskning er fokusert på forståelse av atferd, livssyklus og romlig utbredelse av dyreplankton og fisk. Dynamikken i økosystemet er summen av alle hendelser hos alle individer i alle arter. Det enkelte individs atferd er nesten alltid påvirket av mange faktorer samtidig, så som risiko for å bli spist, mulighet til å finne mat, temperatur og årstid. Matematisk modellering kan derfor være et nødvendig redskap for å forstå begivenhetene. Evolusjonen har gjennom naturlig seleksjon formet livssyklusene og atferdene til akvatiske organismer, slik at de er tilpasset både naturforholdene og andre levende organismer. Selv om det enkelte individ ikke har innsikt i sitt eget liv, så har evolusjonen formet sanseapparet og atferdsresponsene slik at organismen reagerer "fornuftig" på miljøforholdene. For å forstå dynamikken i et økosystem er det derfor nødvendig å forstå hva som motiverer organismene til å ha den atferden de har. Giskes forskning har derfor konsentrert seg om å forstå hva som motiverer individene til å handle, og dette har resultert i matematiske modeller for sild, lodde, torsk, laksesild og dyreplankton. Giske har også (sammen med Per Jakobsen) skrevet en lærebok på norsk om evolusjon og økologi.

BIO 110 Evolusjon og økologi

VIT 210 Mennesket: natur og kultur

 

Updated publication list can be found here:

http://bio.uib.no/te/jg/publications.php

 

Artikler, leserbrev og kronikker på norsk finnes her:

http://bio.uib.no/te/jg/samfunnsdebatt.php

 

 

Lærebok
  • Vis forfatter(e) 2007. Evolusjon og økologi. En innføring. 2. utgave. Fagbokforlaget.
  • Vis forfatter(e) 1999. Evolusjon og økologi - en innføring. Fagbokforlaget.
Vitenskapelig artikkel
  • Vis forfatter(e) 2020. The ODD protocol for describing agent-based and other simulation models: A second update to improve clarity, replication, and structural realism. JASSS : Journal of Artificial Societies and Social Simulation. 1-20.
  • Vis forfatter(e) 2020. Hormones as adaptive control systems in juvenile fish. Biology Open. 1-16.
  • Vis forfatter(e) 2020. Hormonal adjustments to future expectations impact growth and survival in juvenile fish. Oikos. 41-51.
  • Vis forfatter(e) 2019. Decision-making from the animal perspective: Bridging ecology and subjective cognition. Frontiers in Ecology and Evolution. 1-14.
  • Vis forfatter(e) 2018. AHA: A general cognitive architecture for Darwinian agents. Biologically Inspired Cognitive Architectures. 51-57.
  • Vis forfatter(e) 2016. The proximate architecture for decision-making in fish. Fish and Fisheries. 680-695.
  • Vis forfatter(e) 2016. The global potential for carbon capture and storage from forestry. Carbon Balance and Management.
  • Vis forfatter(e) 2016. Impact of hatch-date on early life growth and survival of Mueller's pearlside (Maurolicus Muelleri) larvae and life-history consequences. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 163-176.
  • Vis forfatter(e) 2016. Impact of hatch date on early life growth and survival of Mueller’s pearlside (Maurolicus muelleri) larvae and life-history consequences. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 163-176.
  • Vis forfatter(e) 2016. From sensing to emergent adaptations: Modelling the proximate architecture for decision-making. Ecological Modelling. 90-100.
  • Vis forfatter(e) 2015. What difference does it make if viruses are strain-, rather than speciesspecific? Frontiers in Microbiology.
  • Vis forfatter(e) 2014. The emotion system promotes diversity and evolvability. Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciences.
  • Vis forfatter(e) 2014. Optimal defense strategies in an idealized microbial food web under trade-off between competition and defense. PLOS ONE.
  • Vis forfatter(e) 2014. Marine ecosystem acoustics (MEA): Quantifying processes in the sea at the spatio-temporal scales on which they occur. ICES Journal of Marine Science. 2357-2369.
  • Vis forfatter(e) 2014. A theoretical analysis of how strain-specific viruses can control microbial species diversity. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 7813-7818.
  • Vis forfatter(e) 2013. The Scaled Subspaces Method: A new trait-based approach to model communities of populations with largely inhomogeneous density. Ecological Modelling. 173-186.
  • Vis forfatter(e) 2013. Successful strategies in size structured mixotrophic food webs. Aquatic Ecology. 329-347.
  • Vis forfatter(e) 2013. Effects of the emotion system on adaptive behavior. The American Naturalist. 689-703.
  • Vis forfatter(e) 2012. Selective consequences of catastrophes for growth rates in a stream-dwelling salmonid. Oecologia. 393-404.
  • Vis forfatter(e) 2012. Hva er et menneske? Hjernen mellom natur og kultur i et langt, historisk perspektiv. Arr - Idéhistorisk tidsskrift. 81-85.
  • Vis forfatter(e) 2010. The ODD protocol A review and first update. Ecological Modelling. 2760-2768.
  • Vis forfatter(e) 2009. Quantifying the adaptive value of learning in foraging behavior. The American Naturalist. 478-489.
  • Vis forfatter(e) 2008. Benefitting from bibliometry. Ethics in Science and Environmental Politics. 79-81.
  • Vis forfatter(e) 2007. Exploration or exploitation: life expectancy changes the value of learning in foraging strategies. Oikos. 513-523.
  • Vis forfatter(e) 2006. Co-existence of learners and stayers maintains the advantage of social foraging. Evolutionary Ecology Research. 1311-1324.
  • Vis forfatter(e) 2006. A standard protocol for describing individual-based and agent-based models. Ecological Modelling. 115-126.
  • Vis forfatter(e) 2003. Explicit trade-off rules in proximate adaptive agents. Evolutionary Ecology Research. 835-865.
  • Vis forfatter(e) 2002. The influence of turbidity on growth and survival of fish larvae: a numerical analysis. Hydrobiologia. 49-59.
  • Vis forfatter(e) 2002. Artificial evolution of life history and behavior. The American Naturalist. 624-644.
  • Vis forfatter(e) 2001. Spatial modelling for marine resource management, with a focus on fish. Sarsia. 405-410.
  • Vis forfatter(e) 1999. Implementing behaviour in individual-based models using neural networks and genetic algorithms. Evolutionary Ecology. 469-483.
  • Vis forfatter(e) 1999. A length-based hypothesis for feeding migrations in pelagic fish. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 26-34.
  • Vis forfatter(e) 1998. Modelling spatial dynamics of fish. Reviews in Fish Biology and Fisheries. 57-81.
  • Vis forfatter(e) 1998. Ecology in Mare Pentium; an individual-based spatio-temporal model for fish with adapted behaviour. Fisheries Research. 163-178.
  • Vis forfatter(e) 1997. The significance of optical properties in competition among visual and tactile planktivores: a theoretical study. Ecological Modelling. 123-136.
  • Vis forfatter(e) 1995. Why Pelagic Planktivores should be Unselective Feeders. Journal of Theoretical Biology. 41-50.
  • Vis forfatter(e) 1990. Vertical distribution and trophic interactions of zooplankton and fish in Masfjorden, Norway. Sarsia. 65-81.
Rapport
  • Vis forfatter(e) 1998. Geophysical/Economical Feasibility Study of Ocean Disposal of CO2 at Haltenbanken. 138. 138. .
  • Vis forfatter(e) 1997. Biological impact of CO2 disposal in Norwegian waters: Preliminary review. 2. 2. .
Populærvitenskapelig foredrag
  • Vis forfatter(e) 2019. A 100 000 year aquatic journey with our southern African ancestors.
  • Vis forfatter(e) 2011. Biologi, Fysikk, Kunst og de Store Spørsmål.
Vitenskapelig foredrag
  • Vis forfatter(e) 2006. Coexistence of mobile and sedentary strategies maintains the advantage of social foraging.
  • Vis forfatter(e) 2003. Predictable, chaotic or stochastic; do we understand the nature of the oceanic ecosystem?
  • Vis forfatter(e) 2003. Hedonic models of fish behaviour.
  • Vis forfatter(e) 2003. Evolusjon og økologi.
  • Vis forfatter(e) 2002. Modellering av hedonisk atferd.
  • Vis forfatter(e) 2002. Evolutionary approaches to behaviour in individual-based modelling.
Leserinnlegg
  • Vis forfatter(e) 2000. Den evolverte hjernen. Bergens Tidende.
  • Vis forfatter(e) 2000. Av natur er du kommet, til kultur er du blitt. Bergens Tidende.
Anmeldelse
  • Vis forfatter(e) 2009. Hoffnarrens tale: et ID-blikk på Darwinjubileet og evolusjonsteorien. Naturen. 63-64.
  • Vis forfatter(e) 2009. Gud + evolusjonen = sant + nyttig? Naturen. 61-62.
  • Vis forfatter(e) 2003. Susan Blackmore: Memesket. Naturen. 188-190.
  • Vis forfatter(e) 2003. Lærer vi av Darwin-debatten? Vårt land. 20-21.
Populærvitenskapelig artikkel
  • Vis forfatter(e) 2009. Bli liv! Evolusjonens motor og begynnelse. Naturen. 13-25.
  • Vis forfatter(e) 2009. 150 år underveis mot den store syntesen. Vantro, tvil og tro på Darwin i ny sakprosa. Prosa - tidsskrift for skribenter. 20-26.
  • Vis forfatter(e) 2003. Replikatologi. Naturen. 151-172.
  • Vis forfatter(e) 2001. Millenium Man. Naturen. 30-34.
Kronikk
  • Vis forfatter(e) 2009. Darwins farlige ide. Klassekampen.
  • Vis forfatter(e) 2009. "Ida" er oversolgt. Aftenposten (morgenutg. : trykt utg.).
  • Vis forfatter(e) 2003. Darwin på hjernen. Bergens Tidende.
Doktorgradsavhandling
  • Vis forfatter(e) 2020. Modelling fish growth under hormonal regulation as a factor in Pace of Life.
  • Vis forfatter(e) 1990. Habitat profitability for pelagic animals : adaptive values along continuous vertical gradients.
Intervju
  • Vis forfatter(e) 2012. Rådyre tidsskrifter kveler økonomien til universiteter og høyskoler.
  • Vis forfatter(e) 2008. Skal skolen undervise skapelse?
Dokumentar
  • Vis forfatter(e) 2008. Hva skal vi med UiB.
Vitenskapelig Kapittel/Artikkel/Konferanseartikkel
  • Vis forfatter(e) 2011. Cues and decision rules in animal migration. 20 sider.
  • Vis forfatter(e) 2004. 33. Utilizing different levels of adaptation in individual-based modeling. 15 sider.
  • Vis forfatter(e) 2002. Individual based modelling. 21 sider.
  • Vis forfatter(e) 2001. Chapter 4. Theoretical and statistical models in natural resource management and research. 16 sider.
  • Vis forfatter(e) 2000. Modelling zooplankton dynamics. 97 sider.
  • Vis forfatter(e) 1999. Chapter 2. A model of enhancement potentials in open ecosystems. 15 sider.
  • Vis forfatter(e) 1998. Evolutionary models for fisheries management. 10 sider.
  • Vis forfatter(e) 1998. Ecological Modelling for Fisheries. 58 sider.
Leksikonartikkel
  • Vis forfatter(e) 2003. Models and functioning of marine ecosystems. . I:
    • Vis forfatter(e) 2003. Encyclopedia of Life Support Systems (EOLSS)[elektronisk ressurs]. x.
Poster
  • Vis forfatter(e) 2002. hedonisk atferdmodellering.
Vitenskapelig oversiktsartikkel/review
  • Vis forfatter(e) 2020. Computational animal welfare: Towards cognitive architecture models of animal sentience, emotion and wellbeing. Royal Society Open Science. 17 sider.
  • Vis forfatter(e) 2015. Making predictions in a changing world: The benefits of individual-based ecology. BioScience. 140-150.

Se fullstendig oversikt over publikasjoner i CRIStin.

Forskergrupper