Julia Romanowska

Jeg er en bioinformatikkspesialist (senior ingeniør) ved BIOS (https://www.uib.no/fg/biostatistikk), der jeg bruker min erfaring innen programmering, strukturell bioinformatikk, genetisk epidemiologi, og data science for å utforske store datamengder, gjennomføre kompliserte analyser, og visualisere resultatene. Jeg er også en av grunnleggerne i R-Ladies Bergen (https://www.meetup.com/rladies-bergen/), en del av R-Ladies Global, som er en støttegruppe for kvinnelige R-programmerer.

I mitt tidligere prosjekt, var jeg ansvarlig for kvalitetskontrollen av store dataset av epigenetiske markører (DNA metylering). Som en del av teamet, utviklet jeg en R pakke for å forenkle tilgang til de store data mengder. Vi forberedet og gjennomførte analysene for å sjekke kvaliteten på data og for å omstrukturere dem til videre bruk. Før dette, studerte jeg kompleksiteten av genetiske interaksjoner som kan føre til sykdom. Prosjektet var et samarbeid mellom Prof. Rolv Terje Lie (IGS, UiB) og Prof. Inge Jonassen (CBU, UiB) og integrerte metoder fra statistikk, genetikk, epidemiologi og bioinformatikk, for analyse av store genetiske dataset. Jeg var ansvarlig for implementering av nye metoder som utvikles i forskningsgruppen, hvor jeg brukte R (Haplin R pakke). Ved siden av hovedprosjektet, var jeg involvert i analyser og visualisering av resultatene fra andre studier i forskningsgruppen.

Før jeg kom til Bergen, jobbet jeg på Heidelberg Institute for Theoretical Studies, i Tyskland, hvor jeg skaffet meg forskningsmidler fra den prestisjetunge European Molecular Biology Organization (EMBO). Arbeidsoppgavene mine inkluderte utvikling og implementering av programvare for simulering av biomolekylære interaksjoner (strukturell bioinformatikk), som en del av utviklingsteamet, samt analyse av simuleringene og visualisering av resultatene. Programvaren er skrevet i Fortran (SDA, Simulation of Diffusional Association), men jeg brukte også R og Python. I løpet av mitt dotorgradsstudie i fysikk (med spesialisering i teorietisk biofysikk) ved University of Warsaw, Warszawa, Polen, studerte jeg interaksjoner mellom protein og antibiotika. I løpet av doktorgraden, utivklet jeg selvstendig programvare i Java for analyser av biomolekylære bevegelser (GeoStaS). Parallelt til mitt doktorgradstudie, tok jeg flere fag i informatikk blant annet programmering, algoritmer, kodeteori, og maskinlæring.